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如何更好的觀察到乳腺癌

更新時間:2021-03-28      瀏覽次數(shù):743

如何更好的觀察到乳腺癌

得克薩斯大學安德森分校癌癥中心的研究人員領(lǐng)導的一個小組克服了單細胞DNA(scDNA)測序的先前技術(shù)挑戰(zhàn),開發(fā)了一種以單分子分辨率進行scDNA測序的新方法。這項技術(shù)*揭示了三陰性乳腺癌在染色體不穩(wěn)定的最初爆發(fā)后經(jīng)歷了連續(xù)的基因拷貝數(shù)變化。

這項發(fā)現(xiàn)發(fā)表在《自然》雜志上,為測序數(shù)百種癌細胞提供了一種準確而有效的新方法,同時也為癌癥的發(fā)展提供了新穎的見解。這些見解可以解釋為什么治療并不總是有效的,以及為什么研究人員不能在實驗室中產(chǎn)生同質(zhì)的細胞培養(yǎng)物。

與我們在單細胞DNA測序中的第-一種方法相比,這代表了顯著的進步,其通量,準確性和易用性大大提高?,F(xiàn)在,我們能夠以前所-未有的方式解決腫瘤細胞群體內(nèi)拷貝數(shù)的微小差異。”

Nicholas Navin博士,高級作者,遺傳與生物信息學與計算生物學副教授

這項新技術(shù)被稱為“聲細胞標簽化(ACT)”,首先是通過熒光激活的細胞分選從數(shù)千個細胞中分離出單個細胞核。然后通過三步化學過程將每個細胞中的DNA切割成精-確的片段,添加通用接頭并結(jié)合條形碼以進行下一代測序。

通過這種改進的方法,可以對有限數(shù)量的細胞中的DNA進行測序,研究人員試圖回答有關(guān)癌癥進化的一個常設(shè)問題。納文(Navin)的研究小組先前確定,三陰性乳腺癌會經(jīng)歷標點進化,在染色體不穩(wěn)定的初始爆發(fā)中獲得拷貝數(shù)變化,但是未知癌細胞在該事件后是否繼續(xù)積累變化。

化學過程是通過聲學液體傳輸技術(shù)執(zhí)行的,該技術(shù)使用聲波快速有效地傳輸微量液體。Navin解釋說,早期的scDNA測序方法從開始到結(jié)束需要三天的時間,而新的方法可以在三小時內(nèi)完成。

 

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